捷克的啤酒酿造历史非常悠久，早可追溯到公元859年，公元903年开始出口啤酒，这是世界历史上早的啤酒出口史。在捷克，与啤酒酿造有关的早的税法记载是在1088年：由于当时的农民在自家酿酒像做面包一样普遍，捷克国王符拉蒂斯拉夫二世下旨要求他的国民向教会交纳啤酒花作为什一税。1118年，捷克兴建了家啤酒酿造厂，这时很多家庭早已有了自己的小型啤酒作坊。
由于只有捷克本土的农民有权自产自用啤酒，所以很多城市居民不得不在自己家中偷酿啤酒。随着天主教传入，酿酒受到限制，规定只有修道院的僧侣们才有权酿造啤酒。13世纪后期，波西米亚国王温塞斯拉斯二世设法说服主教取消了酿造啤酒的禁令，让市民可以自由酿酒，这一做法为他赢得了“好国王温塞斯拉斯”的绰号。1295年，皮尔森地区就有260位市民获准酿造啤酒。随着饮酒习惯的渐渐普及，啤酒的获利也越来越高，开始从酿造者在自家贩售转变成量化经营。据记载，在1578年的一次皇家婚宴上，人们酿造了930桶啤酒，而每桶足足有245公升。
然而，由于这时期的酿酒人通常都没有受过教育，不能以科学技术控制发酵过程，啤酒味道并不好，常常有酸腐的劣质啤酒产生。甚至有些异想天开的术士，以死刑犯的骨头或狗头加入麦汁发酵，以为这样可以改良啤酒的品质。为了保证啤酒的质量，捷克对啤酒的鉴定做了些规定：啤酒酿造商要把刚酿得的啤酒送到市政厅接受检查：把酿造好的啤酒泼到专设的长凳上，然后坐上去，几分钟后人粘在长凳上——那么，允许出售；如果不粘，那商人就得挨揍。还有一种检验的方法：泡沫里投入一枚硬币，如果不立即沉没，那么，这种啤酒才可以喝。
直到18世纪，科学家以科学的方式研制出发酵的办法，真正美味的捷克啤酒才得以诞生。科学不但改良了啤酒的品质，还使得啤酒可以批量生产及进行啤酒分级。此后，皮尔森、契斯凯布达札维、布尔诺等地纷纷建立啤酒工厂。世界上部有关啤酒酿造技术的著作就是此时诞生于捷克的，书里规定了温度计以及其它测量工具在酿造过程当中的使用方法。而现在的传统啤酒工艺则是1842年由德国巴伐利亚的啤酒酿造师带到捷克来的。同年，皮尔森的PilsnerUrquell酒厂生产出世界上早的黄金啤酒，奠定了捷克啤酒的声誉。
此后啤酒酿造业在波希米亚地区日益发展。鲁道夫二世国王的御医不仅把啤酒视作难得的健康饮料，还曾撰写过啤酒的疗效专著。捷克工业革命以后，它的啤酒业开始在全世界享有名望。捷克斯洛伐克分裂后，捷克共和国更多地保留了喝啤酒的习惯。
