洪水来源复杂，易引起鱼虾蟹细菌性病变和死亡，人若食用死鱼虾蟹，容易引发疾病，甚至出现中毒。对于洪涝灾害过后出现的死鱼虾蟹，应及时打捞，迅速进行无害化处理，切忌乱扔。另外，来源不明的活鱼，也建议不要食用。
涨水时，因为水中有机物的分解速度加快，耗氧量增大，容易造成鱼虾蟹因缺氧而死亡。鱼虾蟹体表、鳃和肠道中都含有一定数量的细菌，死后极易腐败变质。如果是从养殖场逃逸的，一般没有问题。但如果是从污染水体中跑出来的，例如源头矿区污染，鱼会有重金属污染风险，化工厂附近生活的鱼则体内化学物质含量偏高。此外，还存在农药污染，因此建议不要食用。
